Hunebed D39 ligt samen met hunebedden D38 en D40 op een open plek in het Valtherbos iets ten noorden van Emmen in de Nederlandse provincie Drenthe. Het inmiddels verdwenen hunebed D39a lag hier vlakbij. D39 is het middelste van de drie hunebedden.
Het hunebed wordt toegeschreven aan de trechterbekercultuur. Het is een relatief klein hunebed met nog slechts één deksteen. Oorspronkelijk waren er zes draagstenen en drie dekstenen. Er zijn nog twee sluitstenen. Het hunebed is 4,4 meter lang en 2,5 meter breed. Er zijn nog restanten van de dekheuvel zichtbaar. Deze dekheuvel is in twee fases gebouwd. In de tijd van de trechterbekercultuur lag hij tot de onderkant van de dekstenen en hij is verhoogd in de tijd van de klokbekercultuur. De ingang lag op het zuidwesten.
Ontwikkeld door Marcel Klip